DC散热风扇运转原理：
根据安培右手定则，导体通过电流，周围会产生磁场，若将此导体置于另一固定磁场中，则将产生吸力或斥力，造成物体移动。在直流散热风扇的扇叶内部，附着一块事先充有磁性之橡胶磁铁。环绕着硅钢片，轴心部份缠绕两组线圈，并使用霍尔感应组件作为同步侦测装置，控制一组电路，该电路使缠绕轴心的两组线圈轮流工作。硅钢片产生不同磁极，此磁极与橡胶磁铁产生吸斥力。当吸斥力大于散热风扇的静摩擦力时，扇叶自然转动。由于霍尔感应组件提供同步信号，扇叶因此得以持续运转，至于其运转方向，可依佛莱明右手定则决定。
AC散热风扇运转原理：
AC散热风扇与DC散热风扇的区别。前者电源为交流，电源电压会正负交变，不像DC散热风扇电源电压固定，必须依赖电路控制，使两组线圈轮流工作才能产生不同磁场。AC散热风扇因电源频率固定，所以硅钢片产生的磁极变化速度，由电源频率决定，频率愈高磁场切换速度愈快，理论上转速会愈快，就像直流散热风扇极数愈多转速愈快的原理一样。不过，频率也不能太快，太快将造成启动困难。
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